Andrés Etter trabajó en el Departamento de Ecología y Territorio de la Facultad de Estudios Ambientales y Rurales, donde dirigió un grupo de investigación que se ocupa del modelamiento del cambio de uso del suelo y sus consecuencias ecológicas y socioeconómicas. Su investigación buscó las conexiones del cambio de uso del suelo con los problemas del cambio global y las invasiones biológicas.
Su experiencia se centra en la cartografía de la cubierta del suelo, el análisis del cambio de uso del suelo, la ecología del paisaje, el análisis/modelado espacial y la modelización de especies (invasoras). En general, se interesa en el enfoque interdisciplinario de las interacciones entre el hombre y el medio ambiente. Ha aplicado el enfoque ecológico del paisaje para integrar datos biofísicos y socioeconómicos utilizando la teledetección y los Sistemas de Información Geográficos.
Ha llevado a cabo un amplio trabajo de cartografía y modelación de la cobertura del suelo y del cambio de uso del suelo en Colombia, con énfasis en los ecosistemas de bosque y sabana. Está desarrollando una cuantificación de la huella humana en los ecosistemas.
